根據О-特異性側鏈的存在與否可將脂多糖分為光滑型(smooth-form S-脂多糖)和粗糙型(rough-form R-脂多糖)兩大類，前者的組成成分只有類脂A、核心寡糖及O一特異性側鏈，而居者僅含有類脂A及完整或部分核心成分。雖然兩類脂多糖在某些物理特征上表現出顯著的差異性（主要為表現分子量及水溶性方面)，但在如下方面具有相同特征:

1.內毒素經口服毒性較小，人血則毒性很大。例如人口服150mg 內毒素無不良反應，而靜注0.1 ~0. 5ng/kg 即可引起發熱、頭痛、嘔吐等臨床癥狀。兩者劑量相差百萬倍以上。

2.內毒素作用無特異性，反復作用機體可產生耐受。

3.內毒素耐高熱，一般消毒方法不能滅活，受污染后清除較困難。