水質衛生安全的細菌學指標的主要標準一般以大腸菌數指數和大腸菌數值為主。雖然這些方法使用的原料簡單，操作起來也方便，但每一個標本都需進行檢查，而檢查結果也需要24至48小時以內才會出結果，而使用鱟試驗法檢測水質衛生，在取樣后2小時內便能得到結果，速度非常快。

據國外報道，水里面的總內毒素的濃度(特別是結合內毒素濃度)與細菌菌落數呈正比關系。如果以細菌菌落對總內毒素或結合內毒素的對數換算值繪制出回歸曲線，可以顯示兩者之間的高度相關性。因此，可以通過檢測水中內毒素的量來了解水中的細菌污染程度。鱟試驗法可以檢測到每毫升少至100個革蘭氏陰性菌，因此它是一種非常敏感的方法。此外，鱟試驗法還可以檢測管道水中的其他細菌，如嗜鐵細菌、硫酸鹽等。雖然這些細菌是非致病性的，但它們會引起難聞的氣味，因此它們也具有一定的公共衛生意義。

Diluzio曾在8個城市采集的18份飲用水樣本中，就測出16份飲用水樣本中含內毒素，部分自來水內毒素可達800μg/ml。他還發現，取自密西西比湖作為自來水的樣品中內毒素含量約為400g/ml，而經過處理的自來水中的內毒素含量約為1μg/ml，這表明飲用水在凈化過程中內毒素含量相應降低，但凈化過程中的哪個階段能起到這種作用不得而知。從兩口井中采集的水樣，一口為陰性，一口為陽性，可能與井深有關。推測深井水和土壤的過濾可以去除內毒素。

一般來說，鱟試驗可以在沒有稀釋的水源上進行。對于污染嚴重的水源，離心沉淀后取上清液進行測定。