脂多糖直接作用于B淋巴細胞，增加DNA合成，從而促使B淋巴細胞分裂，故脂多糖為B淋巴細胞的非特異性有絲分裂原。

脂多糖具有免疫原性，即能夠刺激B淋巴細胞產生特異性抗體。脂多糖免疫產生多克隆的抗體反應，主要合成IgM，偶爾也合成IgG和IgA。

B細胞分為兩種亞型：B1和B2，B1在成熟的小鼠中主要分布在腹腔，可以有CD14、CD5、CD44、CD116的表達；而B2即通常的B細胞，則無CD14，CD44分子表達。在小鼠腹腔B1細胞中可以檢測到CD14mRN A ，而脾臟B2細胞中則無CD14mRNA，B1在低內毒素水平時可以發生激活效應，當加入抗CD14抗體時，能夠抑制NF-κB、蛋白質的合成。B2細胞在低內毒素濃度時，無激活效應，只有在高內毒素濃度的條件下才發生激活，可見B1的CD14能夠加速LPS誘導的活化。

脂多糖的促分裂活性和免疫原性是機體抗感染的機制之一，同時也參與某些病理過程的發生和發展。如鼠疫桿菌感染時，細菌在淋巴結內的吞噬細胞中繁殖，脂多糖則刺激B淋巴細胞，在淋巴結生發中心周圍大量增生，導致淋巴結腫大。

Wahl等報道脂多糖能夠激活B和T細胞產生淋巴因子，如單核細胞趨化因子和巨噬細胞激活因子。已經證實脂多糖能夠直接激活B淋巴細胞產生淋巴因子，而激活T淋巴細胞則需要巨噬細胞的參與。